Відділ епідеміологічного нагляду та профілактики інфекційних хвороб
Відділення дезінфекційних заходів
Відділ епідеміологічного нагляду та профілактики неінфекційних зхвороб
Відділ імунопрофілактики
Відділ антимікробної резистентності та інфекційного контролю
Відділ безпеки середовища життєдіяльності
Відділ готовності та реагування на надзвичайні ситуації
Оперативно-диспетчерське відділення
Санітарно-карантинний відділ
Відділ організації лабораторної роботи, системи управління якістю та метрологічного забезпечення
Вірусологічна лабораторія
Бактеріологічна лабораторія
Лабораторія особливо-небезпечних інфекцій
Завідувач лабораторїї
Шиманська Вікторія Володимирівна
Паразитологічна лабораторія
Санітарно-гігієнічна лабораторія
Жеревчук Аліна Іванівна
Відділ бухгалтерського обліку та звітності
Фінансово-економічний відділ
Відділ управління персоналом
Відділ правового забезпечення
Відділ документального забезпечення.
Відділ господарського забезпечення
Відділ інформаційних систем та захисту інформації
Організаційний відділ
Завідувач відділу
Павлік Віктор Анатолійович
Відділ комунікації, організаційної та інформаційно-роз'яснювальної роботи
Відділення із здійснення внутрішнього аудиту
Тренінговий центр